作者: 廠商動態(tài)
自 “孟德爾摩根從豌豆的種植發(fā)現(xiàn)基因以后，二百年內世界上沒有任何人理解這個概念，兩百年后基因研究才慢慢發(fā)展起來”?；蚬こ淘诤荛L一段時間處于靜默期，進入21世紀后，隨著科研水平和IT技術的發(fā)展，基因工程有了突飛猛進的發(fā)展，讓人們利用基因組信息開展精準醫(yī)療并最終改善人類健康成為可能。
從單個基因解密到今天大規(guī)模人群基因組、臨床表征等數(shù)據(jù)的快速積累，基因組研究在近期實現(xiàn)了質的飛躍。業(yè)內專家認識到，要想真正實現(xiàn)基因組信息服務于人類，一方面必須有針對遺傳性疾病、腫瘤等針對性的診療的解決方法，另一方面必須解決海量基因組和臨床數(shù)據(jù)的存儲、分析和共享等方面的挑戰(zhàn)。這正是精準醫(yī)學產(chǎn)業(yè)的巨大發(fā)展機遇。
從全球看，精準醫(yī)療正在得到越來越多國家的重視。國際上目前3個大洲的8個國家紛紛公布了國家精準醫(yī)學計劃，中國“十三五發(fā)展規(guī)劃”也把精準醫(yī)學作為戰(zhàn)略新興產(chǎn)業(yè)。伴隨著精準醫(yī)學研究項目在全球以及國內的全面推進，如何圍繞精準醫(yī)學更好地服務廣大老百姓成為醫(yī)療行業(yè)領導者思考的問題。如果能基于云計算技術打造一個充分整合醫(yī)藥研發(fā)經(jīng)驗和的精準醫(yī)學處理技術的大數(shù)據(jù)云平臺，是不是就能更好地幫助醫(yī)療機構未患者提供方便快捷的精準醫(yī)療服務呢?藥明康德明碼生物科技公司審時度勢，富有前瞻性地認識到了這其中的市場機遇。
華為企業(yè)云加速精準醫(yī)療云落地
國內首個精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)云平臺誕生
在幾年前，冰島完成了全球迄今為止完成的規(guī)模最大的國家精準醫(yī)學研究，對全國總共35萬人口進行了全基因測序，這就產(chǎn)生了30多PB的數(shù)據(jù)，然而，冰島當時的deCODE公司使用的Oracle 數(shù)據(jù)庫的架構無法高效的處理這種海量的數(shù)據(jù)，于是deCODE公司的IT負責人，來自MIT的計算機系教授另辟蹊徑，自己創(chuàng)造了一種適用于基因組大數(shù)據(jù)處理的GOR數(shù)據(jù)庫。這套系統(tǒng)是目前全球唯一一個處理過30多萬人全基因組的數(shù)據(jù)，并在多項國際競標的項目中獲得了多個國家精準醫(yī)學項目的認可，包括英國10萬人基因組、卡塔爾的35萬人基因組計劃，以及美國西蒙基金會自閉癥的基因組計劃等等。
GOR數(shù)據(jù)庫及在此基礎上開發(fā)的序列分析、臨床序列分析和腫瘤分析模塊構成了今天藥明康德明碼科技的精準醫(yī)療大數(shù)據(jù)分析平臺，并已在冰島、卡塔爾和英國的國家級精準醫(yī)學項目上得到廣泛認可和使用。我們完全有理由相信，這一得到國際認可的數(shù)據(jù)分析平臺同樣也能為中國的國家精準醫(yī)學項目做出突出的貢獻。
今年五月，藥明康德聯(lián)合華為企業(yè)云發(fā)布了中國首個精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)云平臺---明碼云。明碼云旨在打造覆蓋全國、標準統(tǒng)一、安全可靠的精準醫(yī)學云服務，推動國內基因組信息及精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)的集中和應用，促進政府相關部門、醫(yī)療行業(yè)、學術界以及業(yè)界在精準醫(yī)學領域的交流與合作，全面助力中國的精準醫(yī)學計劃。
明碼云所獨有的GOR技術世界領先，在全基因組數(shù)據(jù)查詢速度上比基于Hadoop的大數(shù)據(jù)整合平臺高出10倍。明碼云中的WuXiNextCODE cloud系統(tǒng)是專門為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)而開發(fā)的，其通過獨有的彈性計算與數(shù)據(jù)存儲設備實現(xiàn)快速數(shù)據(jù)導入和導出。專為基因組設計的GOR數(shù)據(jù)庫結合臨床序列分析序列挖掘模塊為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)的全面分析提供了更加高效的工具。此外，為了保證數(shù)據(jù)的隱私和安全，明碼云在軟件系統(tǒng)使用了美國DNANexus的安全系統(tǒng)，后者已經(jīng)被美國的國家精準醫(yī)學計劃所采用。
華為企業(yè)云為精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)處理提供強有力的支撐
精準醫(yī)學云平臺需要一個可以通過普通互聯(lián)網(wǎng)獲取專業(yè)的計算資源的快捷通道;一個按需配置，計量收費，用完釋放的高效系統(tǒng);可定制化、彈性可擴展的存儲系統(tǒng)以及界面友好，操作簡單的管理界面。
華為企業(yè)云是一家專注打造企業(yè)級云基礎設施服務的供應商，藥明康德的明碼云選擇與華為企業(yè)云合作，第一保證了IT架構安全，穩(wěn)定，可信賴，華為企業(yè)云所有的機房都是采用T3+標準進行建設，相較于傳統(tǒng)信息化，云服務提供專業(yè)的安全保障體系，通過分布式存儲和異地災備為客戶的數(shù)據(jù)和業(yè)務保駕護航;第二是可以獲得專業(yè)的IT構架維護，華為專業(yè)的人員維護為客戶免去維護的后顧之憂，讓專業(yè)的人做專業(yè)的事，客戶更聚焦自身的核心業(yè)務。第三. 使用效率高，傳統(tǒng)信息化建設需要招標、采購、選型等繁瑣的流程，需要大量的時間，上線一套系統(tǒng)往往需要3-5個月的時間，但是云服務資源是隨時使用的，通過在網(wǎng)站上的簡單操作即可10分鐘快速開通所需資源;第四、輕松擴展，企業(yè)的一些應用會面臨著業(yè)務浪涌和快速擴展，而云服務擁有海量資源池，可以支持企業(yè)業(yè)務彈性擴展;第五，資源共享，基于云計算的統(tǒng)一建設，實現(xiàn)資源最大程度的共享，同時有利于數(shù)據(jù)集中進行大數(shù)據(jù)分析;第六，覆蓋全國的網(wǎng)絡IT資源，華為企業(yè)云目前已經(jīng)在全國布局20余個數(shù)據(jù)中心;
華為公司領先的云計算技術水平和運營能力，結合藥明康德世界一流的醫(yī)藥研發(fā)能力，以及明碼生物科技在分析、挖掘、共享基因組學及精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)方面端到端的豐富技術經(jīng)驗，將為中國精準醫(yī)學大數(shù)據(jù)建立一個可信賴本地化的云計算、云存儲、云分享和交換的全國云服務網(wǎng)絡平臺。
借力云計算，加快推動精準醫(yī)療產(chǎn)業(yè)發(fā)展
“明碼云”平臺所采用的相關技術此前已經(jīng)被同步應用于世界四大洲的智慧城市建設，以及全球多個國家和地區(qū)的精準醫(yī)學項目：從基因發(fā)現(xiàn)到國家基因組計劃，從臨床診斷到智慧醫(yī)院，從靶向藥物研發(fā)到個性化健康管理，一個統(tǒng)一的云平臺可以實時支持基因組學的臨床及科學研究，通過“全國聯(lián)網(wǎng)”在國家層面高效推動精準醫(yī)學研究項目的開展。
目前，精準醫(yī)療領域的發(fā)展在全球尚處于起步期。不過，已經(jīng)有部分醫(yī)療機構和已經(jīng)在用基因檢測作為遺傳性疾病的診斷手段。例如，在罕見病診斷領域全球領先的波士頓兒童醫(yī)院就在用明碼云平臺的數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)進行遺傳病的診斷;國內兒科領域的領軍者復旦大學附屬兒科醫(yī)院也在使用該系統(tǒng)做遺傳病的診斷，并成立了罕見病中心。除此之外，其他的一些機構正在使用這一系統(tǒng)進行基因檢測，以作為抗腫瘤精準用藥的指導。
另一方面，美國的西蒙基金會也是明碼云的用戶，前者擁有目前全球最大自閉癥基因數(shù)據(jù)庫，包含來自閉癥患兒家庭的10,000個外顯子組數(shù)據(jù)。如今，他們可以通過明碼生物科技的臨床發(fā)現(xiàn)分析工具進行云端查詢，凝聚基因組和互聯(lián)網(wǎng)，實現(xiàn)實時查詢與合作。作為數(shù)據(jù)標準以及空前規(guī)模的自閉癥基因組學研究的樞紐，這一數(shù)據(jù)庫能夠與世界上的其他主要數(shù)據(jù)庫無縫對接?？梢哉f，以云計算平臺為依托的基因組醫(yī)療大數(shù)據(jù)的時代已經(jīng)來臨。
小結：
精準醫(yī)療是一種將個人基因、環(huán)境與生活習慣差異考慮在內的新型醫(yī)學概念與醫(yī)療模式，是下一代醫(yī)學的發(fā)展方向，云計算是未來的發(fā)展趨勢，將為企業(yè)創(chuàng)新、信息成本降低、工作方式及商業(yè)模式等帶來根本性改變。
明碼云就是藥明康德依托華為企業(yè)云進軍精準醫(yī)學產(chǎn)業(yè)的一個重要平臺。依托華為企業(yè)云，實現(xiàn)在云端有效完成數(shù)據(jù)存儲，分析和管理，將最后結果交付給專業(yè)的人做專業(yè)的事。藥明康德與華為企業(yè)云的深度合作還體現(xiàn)在人口和疾病隊列的精準醫(yī)學項目上，通過整合臨床研究檢測數(shù)據(jù)與基因組數(shù)據(jù)，將其進行存儲、次級處理以及個性化的高級分析，從而來發(fā)現(xiàn)藥物靶點以及生物標志物。
相信雙方的合作可以幫助行業(yè)和科研工作者更加充分地利用基因組學和大數(shù)據(jù)的力量，推動中國精準醫(yī)學研究以及個性化健康管理，最終實現(xiàn)以基因為出發(fā)點來規(guī)劃個人的飲食生活習慣，達到精準健康的目的。